كما حققت النيابة العسكرية المصرية يوم 7 اغسطس 2011 معها
بتهمة الإساءة إلى المجلس العسكري عبر ما تكتبه على صفحتها على موقع فيسبوك.
وقررت النيابة إخلاء سبيلها بكفالة 20 ألف جنيه مصري واستمرار التحقيق معها في الاتهامات المنسوبة إليها.
كما أكد مصدر مسئول بهيئة القضاء العسكرية لموقع مصراوي أن الناشطة أسماء محفوظ سوف تمثل أمام المحكمة العسكرية نهاية الاسبوع المقبل في القضية رقم 55 لسنة 2011 إداري عام المدعى العام العسكري، وذلك في تهمة السب والقذف والتحريض على أعمال مسلحة